Fils de l'archiduc Karl Stephan 1860-1933 et de l'archiduchesse Maria Theresia d'Autriche-Toscane 1862-1933. Il fut un officier de l'armée impériale austro-hongroise puis de l'armée polonaise. En 1919, il est devenu citoyen polonais.
En 1920, il a épousé Alice Gräfin Badeni (née Ankarcrona), elle était née dans une famille noble suédoise, mariage non égal en naissance (Ils furent titrés prince et princesse von Altenburg par l'archiduc Otto en 1949).
Dans les années 1920-30, les monarchistes polonais le présentaient comme leur candidat au trône.
Prisonnier des Allemands pendant leur occupation de la Pologne qui le torturèrent, il quitta en 1946 son pays (livré aux communistes) pour aller finir sa vie en Suède (pays natal de son épouse).